博奥晶典专题报告即将亮相CCFM9 | 国家专利技术提高NIPT实验成功率
日期:2019-05-10 来源:

        第九届中国胎儿医学大会(CCFM9)即将在上海开幕,广大从事胎儿医学的临床工作者、学术机构以及研发企业将同聚一堂,共同学习及探讨国内外的新研究、新观点、新技术,以期规范国内胎儿医学的临床实践。

        博奥晶典将携“胎儿游离DNA浓度富集新技术”亮相第九届中国胎儿医学大会。

        博奥晶典与南京市妇幼保健院合作开发的胎儿游离DNA富集方法可用于NIPT的检测。其研究成果发表在Journal of Translational Medicine期刊上(IF=4.17)。该方法可有效富集胎儿游离DNA, 可降低NIPT假阴性率、提高实验成功率,提高NIPT的检测质量。同时该方法还具备在NIPT检测CNVs和单基因疾病领域的可行性。

文献详情

研究背景:

        基于胎儿游离DNA(cffDNA)的NIPT技术已广泛应用于临床。然而,这种方法的可靠性在很大程度上取决于母体血浆中cffDNA的浓度。当cffDNA浓度较低时,可能导致检测失败或出现假阴性结果。该研究根据胎儿DNA与母源DNA的片段大小关系,建立了一种富集cffDNA的方法,并评价了新的NIPT方法是否能提高检测质量。

研究方法:

        利用已有的10000份NIPT数据,优化富集片段选择策略。回顾性地对1415个NIPT样本进行了cffDNA富集,并将结果与最初的NIPT结果进行了比较。

研究结果:

        10000个NIPT数据显示,游离DNA短片段(<160bp)中的胎儿DNA的浓度明显较高。在1404例常规病例中采用新的NIPT策略,胎儿DNA浓度由11.3±4.2%提高到22.6±6.6%,新方法使试验失败率显著下降(0.1%对0.7%,P<0.01)。此外,在45.5%的假阴性病例中,采用胎儿浓度富集的新方法成功检测到胎儿三体。

研究结论:

        研究表明,通过选择性地富集短的游离DNA片段来提高cffDNA浓度是可行的。新方法可以避免大部分NIPT实验失败,并减少近一半因cffDNA浓度低引起的假阴性结果,从而提高NIPT在临床上的整体表现。研究数据也表明该方法在使用NIPT检测CNVs和单基因疾病领域具备可行性。

胎儿浓度富集技术获得国家专利

        该胎儿游离DNA浓度富集新技术是通过富集母体外周血中某一长度的游离DNA进行测序和数据分析,可以富集母体外周血中胎儿的游离DNA,从而将胎儿游离DNA浓度(百分比)提高至原来的1.5~4倍,胎儿游离DNA浓度均值从13%提高至20%~40%,提高NIPT检测的准确性。该技术目前已获得国家专利。

专利号:CN107541561B

胎儿染色体微缺失/微重复无创产前基因检测(NIPT-plus)

        基于以上胎儿游离DNA浓度富集技术成果,博奥晶典依托新一代高通量基因测序平台开展的胎儿染色体微缺失/微重复无创产前基因检测(NIPT-plus),通过检测母体外周血,判断胎儿是否存在染色体微重复/微重复综合征等染色体亚结构异常的100种染色体异常疾病,可更准确、更全面、更高效地预防和降低出生缺陷率,有助于解决染色体疾病防治过程中所遇到的临床问题。

博奥晶典NIPT-plus更多成果

        博奥晶典与陆军军医大学第二附属医院合作进行的8141例单胎染色体非整倍体和微缺失/微重复无创产前基因检测队列研究,其成果发表在Human Genomics期刊上(IF=3.5)。该研究招募了8141名单胎妊娠女性进行胎儿异常检测分析,证明了在全基因组水平和>3Mb分辨率下进行胎儿染色体微缺失/微重复无创产前检测的可行性,但仍需提高NIPT技术检测染色体微缺失/微重复的特异性、准确性和灵敏度。而准确预估孕早期胎儿游离DNA浓度和优化CNV生物信息学算法可显著提高NIPT的检测准确性。

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